廣州市黃埔區(qū)學(xué)大道攬?jiān)侣窂V州企業(yè)孵化器B座402
電話:020-85625352
手機(jī):18102256923、18102253682
Email:servers@gzscbio.com
Fax:020-85625352
QQ:386244141
3D基因組的調(diào)控模型
我們已經(jīng)知道,染色質(zhì)是由獨(dú)立功能單元TADs(拓?fù)湎嚓P(guān)結(jié)構(gòu)域)組成的,TAD是由多個(gè)相互靠近的功能環(huán)組成。因此。我們研究3D基因組,實(shí)際上是研究DNA的功能環(huán)機(jī)構(gòu),前面我們已經(jīng)了解到染色質(zhì)的環(huán)形結(jié)構(gòu)包括DNA,調(diào)節(jié)蛋白及黏著蛋白。下面我們來了解一下染色質(zhì)功能環(huán)的幾種基本模型。
A圖為典型的絕緣子調(diào)控模型,其中CTCF是一種重要的絕緣子蛋白。當(dāng)CTCF蛋白成環(huán)時(shí),CTCF在空間上阻隔了增強(qiáng)子與基因啟動(dòng)子之間的聯(lián)系,RNA聚合酶II無法招募足夠的轉(zhuǎn)錄因子,以致于基因無法正常轉(zhuǎn)錄。當(dāng)CTCF環(huán)打開后,增強(qiáng)子與基因啟動(dòng)子之間的阻隔消失,增強(qiáng)子招募激活型轉(zhuǎn)錄因子,與RNA聚合酶II互作,開啟基因轉(zhuǎn)錄。
B圖為經(jīng)典的遠(yuǎn)程增強(qiáng)子調(diào)控模型。這類模型的調(diào)控模式與A圖相對(duì),它是成環(huán)后增強(qiáng)基因的表達(dá),而不是抑制。其中的調(diào)節(jié)蛋白不再是CTCF蛋白,而是一些轉(zhuǎn)錄因子等其他調(diào)控元件。在DNA的一維結(jié)構(gòu)上,增強(qiáng)子與基因啟動(dòng)子相隔較遠(yuǎn),在沒有成環(huán)的條件,增強(qiáng)子無法啟動(dòng)基因表達(dá)。但當(dāng)環(huán)形成后,遠(yuǎn)程增強(qiáng)子與基因啟動(dòng)子的距離被拉進(jìn),增強(qiáng)子與RNA聚合酶II互作,啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄。