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RNA結合蛋白免疫沉淀技術 RIP

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實驗常見問題

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結果分析

      對于一幅RIP-qRT-PCR實驗結果Figure,應包含位點作用示意圖、qRT-PCR結果數(shù)據(jù)分析圖,并應在Supplement中補充相關的驗證性實驗圖片,具體如下圖所示。

RIP model figure

      RNA與蛋白綁定結合位點。經(jīng)過一定處理,RNA原本以雙鏈莖環(huán)結構,不結合RBP蛋白和miRNA,經(jīng)過處理后莖環(huán)結構打開,一條鏈結合RBP,另外一條鏈結合miRNA和RISC。

 

      Figure A:

      某基因的引物設計位點。

RIP model figure A


      Figure B:

      上圖:RNA結合蛋白,與未處理(Mock)組比較經(jīng)過處理(Treat)后位點1、2結合量明顯大量增加;下圖:RBP IP組,陰性對照組Mock IgG IP,陽性對照組SNRNP70 IP。

RIP model figure B


      Supplement:

      WB檢測RNA結合蛋白的表達。

RIP model figure S.A

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